全部论文解读

论文解读 · 07 / 细胞死亡与炎症

GSDMD 缺失时炎性小体并未失效:caspase-1 切割 Bid 启动凋亡

导语:Gsdmd 敲除的巨噬细胞在沙门菌感染后不发生典型的快速焦亡,但仍会死亡,只是死亡变慢、形态变成膜出泡的凋亡样,同时 caspase-3、-8、-9 都被激活。caspase-1 在失去 GSDMD 这个底物后做了什么,是本文要回答的问题。

Nature Communications · 20198 分钟阅读讨论这篇论文
从实验问题开始读
GSDMD 缺失时,caspase-1 在 D59 切割 Bid,经细胞色素 c、APAF1 和 caspase-9 激活 caspase-3;GSDME 可参与后续膜破裂。此图只展示论文的主要 Bid 依赖路线。
HIGHLIGHTS(解读总结)
  • 01

    主要发现:GSDMD 缺失时,caspase-1 激活后启动 caspase-3 依赖的凋亡而非焦亡,由 caspase-3 切割 GSDME 完成后续膜破裂;

  • 02

    关键机制:caspase-1 在 D59 位点切割 Bid,经 tBid–细胞色素 c–apoptosome–caspase-9 轴激活 caspase-3;

  • 03

    研究意义:GSDMD 的表达量决定 caspase-1 下游的死亡方式,天然低表达 GSDMD 的细胞(如皮层神经元)中炎性小体激活可表现为凋亡。

本文目录

一、这篇文章回答了什么

炎性小体激活 caspase-1 后,公认的结局是 GSDMD 介导的焦亡。本文的问题是:在没有 GSDMD 的细胞中,caspase-1 激活会引发什么? 结论是:caspase-1 经切割 Bid 启动线粒体凋亡通路,细胞死于凋亡,随后由 caspase-3 切割 GSDME 完成膜破裂。

二、论证逻辑梳理

第一步:确认 GSDMD 缺失时的死亡依赖 caspase-1 且呈凋亡特征(图 1–2)。作者在 Gsdmd−/− 巨噬细胞中转染 poly(dA:dT) 或感染沙门菌,发现 LDH 释放比野生型慢但仍显著,细胞出现膜出泡等凋亡形态,caspase-3、-8、-9 均被切割激活,而 Casp1−/− 细胞无此反应;ASC 缺陷的 RAW264.7 细胞同样如此,排除了 ASC–caspase-8 通路。为了直接检验 caspase-1 的能力,作者用药物诱导二聚化的 caspase-1 系统处理结肠癌细胞,发现 Gsdmd 敲除后 caspase-1 激活引起凋亡,回补野生型 GSDMD 恢复焦亡,回补打孔缺陷的 I125N 突变体则不能。以上结果表明,caspase-1 下游走焦亡还是凋亡,由 GSDMD 的打孔活性决定。

Figure 2完整原图
查看完整 Figure ↗
原论文完整 Figure 2(A–G)
原文 Figure 2(A–G)

第二步:解析凋亡通路(图 3–6)。作者在 Gsdmd 敲除细胞中逐一检验下游分子,发现敲除 caspase-3 几乎完全阻断死亡,敲除 caspase-9 显著减弱 caspase-3 激活,敲除 caspase-2、-6、-7、-8 则无影响。已知 caspase-1 体外可切割 Bid,作者检测发现 caspase-1 激活后 Bid 被切割为 tBid,伴随线粒体去极化、细胞色素 c 释放和 APAF1–caspase-9 复合体形成;敲除 Bid 严重延迟上述事件。作者用回补实验定位切割位点:回补野生型或 D75A 突变型 Bid 恢复凋亡,回补 D59A 则不能。以上结果表明,caspase-1 在 D59 位点切割 Bid,经线粒体–caspase-9 轴激活 caspase-3。

Figure 6完整原图
查看完整 Figure ↗
原论文完整 Figure 6(A–G)
原文 Figure 6(A–G)

第三步:回答"那 LDH 是谁放的"(图 3)。GSDMD 缺失细胞的 LDH 释放由谁执行?作者发现 caspase-3 激活后切割 GSDME,敲除 GSDME 使早期膜损伤(PI 摄取、LDH 释放)大幅减少,但不影响磷脂酰丝氨酸(PS)外翻和膜出泡。以上结果表明,caspase-1 启动的凋亡经 caspase-3–GSDME 快速进入继发性坏死。

Figure 3完整原图
查看完整 Figure ↗
原论文完整 Figure 3(A–G)
原文 Figure 3(A–G)

第四步:检验生理相关性(图 9)。作者检测天然不表达 GSDMD 的 L929 细胞和小鼠皮层神经元,发现 caspase-1 激活同样诱导 Bid 依赖的凋亡;沙门菌感染实验中,敲除 Bid 的细胞内细菌存活增多。以上结果表明,这条凋亡通路存在于天然 GSDMD 阴性细胞中,并能替代焦亡限制胞内菌。

Figure 9完整原图
查看完整 Figure ↗
原论文完整 Figure 9(A–E)
原文 Figure 9(A–E)

三、对实验的启示

  1. Gsdmd 敲除细胞里的 LDH 释放不等于焦亡:本文中它来自凋亡后的继发性坏死,需配合 caspase-3、GSDME 切割和细胞形态判断死亡方式。
  2. 做 Gsdmd 敲除的炎性小体实验要检查本底表达:L929、神经元等天然低表达 GSDMD 的细胞中,caspase-1 激活本来就走凋亡。
  3. Bid 是 caspase-1 与凋亡通路之间的连接点:检测 tBid 和 D59 位点切割是判断这条通路是否参与的最直接读数。

四、站内文献关联

(以上跨论文比较为综合解释,非任一原文的直接结论。)

这篇论文还没有回答什么

局限:① Bid 非依赖的第二条凋亡通路只在个别细胞系中观察到,机制未明;② 原代巨噬细胞中 GSDME 的作用与文献存在分歧,尚需双敲小鼠验证。

原始研究

Caspase-1 initiates apoptosis in the absence of gasdermin D

Tsuchiya, Kohsuke; Nakajima, Shinsuke; Hosojima, Shoko; Thi Nguyen, Dinh; Hattori, Tsuyoshi; Manh Le, Thuong; Hori, Osamu; Mahib, Mamunur Rashid; Yamaguchi, Yoshifumi; Miura, Masayuki; Kinoshita, Takeshi; Kushiyama, Hiroko; Sakurai, Mayumi; Shiroishi, Toshihiko; Suda, Takashi Nature Communications. 2019;10:.

文中配图来自资料库中已核实的原论文,保留原图标识、坐标与对照;图号和来源见资料库登记。

参考文献
  1. Tsuchiya K, Nakajima S, Hosojima S, et al. Caspase-1 initiates apoptosis in the absence of gasdermin D. Nat Commun. 2019;10:2091. doi:10.1038/s41467-019-09753-2
  2. He WT, Wan H, Hu L, et al. Gasdermin D is an executor of pyroptosis and required for interleukin-1β secretion. Cell Res. 2015;25(12):1285-1298.
  3. Rogers C, Fernandes-Alnemri T, Mayes L, et al. Cleavage of DFNA5 by caspase-3 during apoptosis mediates progression to secondary necrotic/pyroptotic cell death. Nat Commun. 2017;8:14128.

论文讨论

无需注册,昵称可留空
说说你的理解

讨论图表、结论,或补充相关文献。

0 / 2000 · 留言审核通过后公开

正在加载留言…